Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otop3Q80UF9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms