Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms