Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfsf18Q7TS55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tnfsf18Q7TS55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf18Q7TS55 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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