Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim17Q7TPM3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms