Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mycbp2Q7TPH6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms