Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700010I14RikQ7TPG0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms