Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uhrf2Q7TMI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uhrf2Q7TMI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms