Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms