Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vma21Q78T54 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vma21Q78T54 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Vma21Q78T54 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vma21Q78T54 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms