Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim12Q78RX3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms