Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms