Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Efr3bQ6ZQ18 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Efr3bQ6ZQ18 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efr3bQ6ZQ18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efr3bQ6ZQ18 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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