Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms