Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms