Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp2b4Q6Q477 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b4Q6Q477 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms