Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfrkbQ6PIJ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms