Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc57Q6PHN1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms