Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc36Q6PDM4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms