Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msl1Q6PDM1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msl1Q6PDM1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msl1Q6PDM1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms