Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rundc3bQ6PDC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc3bQ6PDC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms