Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trak1Q6PD31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trak1Q6PD31 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms