Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Garem2Q6PAJ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem2Q6PAJ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem2Q6PAJ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms