Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnpQ6P8I4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcnpQ6P8I4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms