Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc148Q6P5U8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc148Q6P5U8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc148Q6P5U8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms