Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7bQ6P4U0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7bQ6P4U0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7bQ6P4U0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7bQ6P4U0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7bQ6P4U0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7bQ6P4U0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Thsd7bQ6P4U0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thsd7bQ6P4U0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms