Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig8Q6P3A4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms