Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtl3Q6P1Y1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtl3Q6P1Y1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtl3Q6P1Y1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms