Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Efcab6Q6P1E8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efcab6Q6P1E8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Efcab6Q6P1E8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms