Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slx4Q6P1D7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slx4Q6P1D7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slx4Q6P1D7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slx4Q6P1D7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms