Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms