Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf8Q6DID3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scaf8Q6DID3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scaf8Q6DID3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms