Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TroQ6DIC6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TroQ6DIC6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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