Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzrn3Q69ZS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms