Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrcc1Q69ZB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrcc1Q69ZB0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms