Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn4Q69Z26 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntn4Q69Z26 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms