Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptbn2Q68FG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms