Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgefl1Q68EF8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rapgefl1Q68EF8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgefl1Q68EF8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms