Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprdQ64487 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprdQ64487 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprdQ64487 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms