Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pan3Q640Q5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms