Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccdc18Q640L5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc18Q640L5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc18Q640L5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc18Q640L5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
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