Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vat1Q62465 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vat1Q62465 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms