Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha6Q62413 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha6Q62413 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms