Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Supt6hQ62383 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms