Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sycp1Q62209 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sycp1Q62209 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms