Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn9aQ62205 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms