Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim27Q62158 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim27Q62158 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim27Q62158 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms