Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcbp2Q61990 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms