Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga6Q61739 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms