Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna11Q61716 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna11Q61716 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms