Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irf9Q61179 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms